Laboratorium Kimia di SMA Muhammadiyah 1 Palembang dilengkapi dengan peralatan dan bahan kimia untuk eksperimen mengenai reaksi kimia, asam-basa, dan proses kimia lainnya. Siswa mempelajari teori kimia melalui kegiatan praktis, seperti pencampuran bahan kimia dan pengamatan perubahan yang terjadi.